Jason Kingsley, CEO da Rebellion, sugeriu o potencial de uma terceira parcela da série Evil Genius, embora ainda não esteja pronta para fazer nenhum anúncio oficial. A franquia é particularmente querida por Kingsley, que atualmente está explorando maneiras inovadoras de elevar a série a novos patamares.
Kingsley expressou que o tema da dominação mundial, central para a série Evil Genius, poderia transcender o gênero do simulador de construção de base tradicional e ser adaptado em outros formatos estratégicos de jogos. Embora projetos específicos ainda estejam em discussão, a equipe da Rebellion está cheia de novas idéias para o futuro da franquia.
A sequência, Evil Genius 2, que atingiu o mercado em 2021, recebeu críticas "principalmente positivas" dos críticos sobre a Metacritic. No entanto, a recepção da comunidade geral de jogos foi menos entusiasmada. Apesar dos aprimoramentos em gráficos e esforços para abordar questões do jogo original, muitos jogadores sentiram que o Evil Genius 2 não cumpriu seu antecessor. As críticas comuns incluíram a mecânica do mapa global, o declínio na eficácia dos lacaios e vários elementos estruturais, entre outras questões.